Saturday, May 16, 2009

macvim-kaoriya

Windows 7 にgvimのkaoriya版をインストールしてみたら使いやすかったのでOSXでも導入してみた。

macvim-kaoriyaから、macvim-kaoriya-20090511.dmgをダウンロードしてインストール。
設定は.vimrcと.gvimrcをロードする。

これまでterminal上で作業した方が楽だと思ってたけど、GUI版も意外と使いやすいなあ。

Thursday, May 14, 2009

/etc/zlogout の clear

/etc/zlogout に clear があって、ログアウトの度にクリアされる。
よく見たら /etc/zprofile も /etc/zshrc も /etc/zlogin も特に使っていないので、読み込まないようにした。

unsetopt global_rcs

Windows 7 覚え書き

Windows Vista -> Unix への接続がよくわからなかったので、テスト用に Windows 7 を Macbook OSX 10.5.7 上の virtualbox にインストールしてみた。
設定は基本的に初期のまま、HDD: 20GB, メモリ 768 MB。

cygwin なしで使えるか試してみた。
ターミナルクライアントはTera Termを採用。
X window は Xming-mesa で接続可能。
Xming だと、openGLのアプリケーション(例えばVMD)が動かなかった。

teraterm-4.6.2.exe
Xming-mesa-6-9-0-31-setup.exe
Xming-fonts-7-4-0-3-setup.exe
をそれぞれインストール。特に変更はしてない。

Xmingを立ち上げる。
外からの通信についてwarningがでるが、許可。
Xmingを立ち上げたままで、Tera Termを起動。
設定 --> ssh転送 --> リモートのアプリケーションをローカルのXサーバに表示するにチェックを入れる。
サーバと接続。
これでX windowが動く。
ファイル --> SSH SCP などから転送も可能。
ローカルにunix環境がないと不思議な気分になります。

Thursday, April 16, 2009

pymol覚え書き

残基を名前で選択(ここではHEMEを選択した場合)
select HEME, resn HEC
など
残基を残基数で選択
select HEME, 81/

タンパクがいくつかある場合には、
select HEME, A/81/
のような形で選択

困ったらDisplay→Sequence onにチェックしてみる

Friday, April 10, 2009

vimスペルチェック覚え書き

vim7のスペルチェック機能について。
ホームディレクトリに
.vim/spell/
を作っておく。
vim上で
:set spell
で修正箇所の背景が変化する。
操作一覧。
]s 次の単語へ移動
[s 前の単語へ移動
z= スペル候補を表示
zg 正しい単語として登録
zw 間違った単語として登録
zug, zuw 登録した単語を取り消す
これくらいで一通り使える。