Wednesday, July 08, 2009

RMSD 覚え書き

vmdを開き、File --> New Molecule ... よりpsf, dcdを読ませる。
Extensions --> Tk Console
にて、
set output [open rmsd.dat w]
set numf [molinfo top get numframes]
set ref [atomselect top "protein and noh" frame 0]
set sel [atomselect top "protein and noh"]
for { set i 1 } { $i < $numf } { incr i } {
$sel frame $i
$sel move [measure fit $sel $ref]
puts $output "[measure rmsd $sel $ref]"
}
close $output
でrmsd.datができる。

Friday, July 03, 2009

BlogPress

BlogPress に変更しました。
ラベルは付くのかな?

ちゃんと付くみたいね。

Wednesday, July 01, 2009

BlogWriterが使えそう

iPhone/iPod touch 用のBlogWriter Liteをつかってみた。
大丈夫かな?

ラベルがつかない?